原来直到今天我才搞清楚DNA的结构……

一直以来我对DNA的结构只停留在反向平行的双螺旋的程度。今天在翻《创世纪的第八天》,讲到DNA结构模型构建时,说DNA的两条链旋转方向是不同的,没搞明白,想了想DNA的双螺旋,发现空间想象能力大幅下降,索性拿出纸笔根据沃森和克里克那时的实验证据画了下DNA的结构,却总是和书上的表述有差距。刚开始以为翻译问题,后来找到了DNA的分子结构图才发现头脑里对DNA结构的印象完全错误。当时测出DNA是单斜晶体,DNA分子有一个C2轴,就是这个证据推导出了DNA的双链。但这个C2轴不是DNA螺旋所绕的轴,而我一直把它当作C2轴了,看了好久才想明白这个问题,结构化学还是没学好啊……


附DNA结构图:
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——————————推荐的分割线——————————————————
《创世纪的第八天》强力推荐,是第一本我看的时候会做笔记的书,对搞科研来说是绝佳的入门教程。下面摘些有意思的:(持续更新)
1.DNA结构发现史也很有意思。其实沃森最早的双链模型就是我之前想象的那样,而克里克指出了其在对称性方面的错误,但沃森的结构化学和我差不多,一直理解不能,双螺旋最后的结构还是克里克做出来的。
2.鲍林搞出个三链的结构,发的文章里错误百出,沃森看完后就一句话:“巨人不懂基础化学”。
3.讽刺的是,鲍林在之前证明蛋白质的α-螺旋模型是正确的而否定了布拉格的模型时就说过,布拉格不懂结构化学的基础知识在乱整,让布拉格很是蒙羞。
4.而鲍林没能得出正确结构的主要原因是拿到的DNA的X射线衍射图案不够漂亮与引用数据有误。沃森也是很巧地在罗莎林·富兰克林的实验室看到一张被忽视的衍射照片,一眼就从就是这张著名的照片里看出了DNA的螺旋结构。当晚他就骑车到学校,再从后门翻进去开始构建模型。
5.罗莎林·富兰克林是当时第三位独立研究DNA结构的科学家,在做X射线衍射图案方面做了大量工作。这是一位具有悲剧命运的女科学家,在当时对女性还不能接受的科研环境里,以超乎常人的努力要把DNA结构解出来,可惜天道不酬勤,数次走上歧路,最终离真莫道不消魂相只有一步之遥,后来英年早逝。而《创世纪的第八天》作者评价道,她需要的,只是一位合作者。

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化学班人物志—消极分子三

    消极分子
    “古之成消极者,必先经历三种境界:‘此时消极胜积极’,此第一境也;‘消极者,神消而形不消也’,此第二境也;‘无消而无不消也’,此第三境也。”(《消极词话》)
    消极分子是化学班一个特殊阶半夜凉初透级。他们人数众多(几乎曾占了化学班一半人),是化学班的中坚力量,在化学班影响极大。而且他们消极的趋势还在不断上升,范围也不断扩大。在化学班,“消极”业已取代一切贬义词,每人随口都是“消极”,“消极”成为了我们06级化学班最大特征,众人皆知。
    消极分子中有一些代表人物,他们,或在化学班继续呼风唤雨,或已退班多年,让我们来认识一下这些化学班平凡又特殊的人物。
    王Li,最著名的消极分子之一。
    钟V,外号“鸭子”、“鸭哥”,36班老张爱徒。消极分子中精神领袖之一。
    CC,又名“翠翠”,其名又可释为“催化加成”(嗯,很有化学修养)。36班人氏。
    罗JZ,来历不明。
    此四子者,谓曰“消极四人帮”。但他们还不及另一传奇人物——曾经的大消极LiPAs。其长期在化学班挂名,但长达一年未见踪影,倒经常在篮球场欣赏到其球技。后浪子回头,又成为化学班一代传奇。
    上述人物,是还留在化学班的,而据考证,最消极者乃前化学班学员——以何MX为代表的一帮人。提起何MX,依稀记得其身材高大,面相宽厚,总背个书包,到班上也很早,似积极之人,未料其也是最后一排奇异故事研究会成员。后来早退人群中也渐渐有其身影了,再到后来竟不记得有此人了。只是在川师大时牛一句“鸭哥要积极了,何MX都进冬令营了”引起大家一阵狂笑,才发现大约何MX等人的确已经彻底消极了。


附1:
青玉案·消极
东风吹落花千树
三点过
张无语
网吧电玩香满路
魔兽声动
实况光转
周末欲何度
消极分子不见影
怒眉紧锁老张去
众里寻他千百度
蓦然回首
那人已在
奋战P.S.Two


附2:
鸭哥版十大消极分子
⒑ 余JH   深为PS2诱惑,无力自拔,无药可救。
   消极指数 ★★         影响指数 ★★★          综合评定 ★★★
⒐ 黄Ga     上课废话太多,快乐自己,虐佳节又重阳待他人。
   消极指数 ★           影响指数 ★★★★★      综合评定 ★★★
⒏ 曹H2O(s)     为博某女一笑,逃课数十载,赞乎?泣乎?
   消极指数 ★★★       影响指数 ★★★          综合评定 ★★★
⒎ 罗JZ   自甘堕落——造孽!
   消极指数 ★★★       影响指数 ★★★★        综合评定 ★★★☆
⒍ 李J     上课来去匆匆,校外久转不归。
   消极指数 ★★★★     影响指数 ★★★          综合评定 ★★★☆
⒌ 张J     上课寻周公,被大嘴刘发现,可悲……
   消极指数 ★★★★★   影响指数 ★★★          综合评定 ★★★★
⒋ 王Li     醉八仙梦美女,酯中存在过氧键,生也消极,死也……
   消极指数 ★★★★★   影响指数 ★★★★        综合评定 ★★★★☆
⒊ LiPAs   为追MM,装病请假,身为学习委员,不思进取。
   消极指数 ★★★★★   影响指数 ★★★★★      综合评定 ★★★★★
⒉ 何MX   走错教室入网吧,奥赛书怎成小说???
   消极指数 +∞         影响指数 ★★★★★      综合评定 元老级
⒈ 贺斯很贵   身为人师,不以身作则,以睡觉为由,耽误化学班三课时。
   消极指数 ★★★★★   影响指数  +∞           综合评定 教父级

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才知道柳大的科普小品文出集了


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http://www.douban.com/subject/2360390/

我知道你明天干了什么
   【目录】
  闪光的生命(代序).
  我们还在旅途中——科学的研究方法
  托·阿·爱迪生VS哈利·波特——技术、魔法大比拼
  神坛下的丘比特
  100个“为什么不”——怀疑论者的颂歌
  我与催眠者
  镜子和旋梯
  人与非人..
  痛,并活着
  我知道你明天干了什么
  最伟大的战争
  轻装向彼岸
  龙迹
  让尸体说话
  捕风捉影——谁说他们曾来过?
  看不见的手
  白色链条——最后的遗产
  附录:纪念文扬...

惊奇档案这些东西是曾经的最爱,也一度想写出柳大这种文风的东西,可惜实在懒于执笔。现在看到以姬十三带动的科学松鼠会的出现,又似乎燃起希望。

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回顾2008

1月
南方的大雪预示着一年的不平静,变局来临?
新东方很好很强大。
2月
一个假期一部动漫之《绝望先生》:
系色望先生,死了怎么办?可符香教主,超积极的外表下究竟隐藏着何等的绝望?
3月
激流在中国暗地里涌动。
牦牛党作乱,火锅城虚惊。真莫道不消魂相只有一个?眼见为实还是Matrix?
4月
东篱把酒黄昏后制戏言耳,爱国却不是口号。
托福,DOTA。
5月
黑色。哀悼。希望。
很想做点什么,但深感无力,何时才能从旁观中走出?
6月
王者西班牙。
7月
进化心理学,量子力学与复杂性科学之后又一让人着迷的学科。
一个假期一部动漫之《EVA》:
95年的作品至今仍是神作,末世氛围的渲染,人物性格与心理的细致刻画,宗教与高科技的故弄玄虚,的确做出了一部很有意思的动画,明明是很悲伤的基调却能让人内心平静;《EVA》后再无动画可看。
Fly me to the moon 太惊艳了,从此长存于MP3中。
8月
在家平淡的生活,买菜,做饭,陪小妹玩仙剑,补完了灌篮高手全国大赛漫画,看奥运。
超萌的Wall-e和Eve,无数让人感触的细节,一切尽在不言中的真情,依然有才的片尾,从此成为Pixar的死忠。
9月
开始以实验室为家,不过最终还是难破实验之诅咒。
《Lucky☆Star》OVA、《The Big Bang Theory》Season2相继来临:
时隔一年幸运星终于出了一集新片,片头一个平凡的早晨各主角依次出场,大打哈欠的此方,认真读报的镜,睡眼朦胧的司,如同多年的老友重逢,令人热泪盈眶。
四个天才与美女Penny也回来了。Sheldon开始对社会习俗感兴趣了,Penny也会说薛定谔的猫了。
10月
京城高中同窗会。
人比黄花瘦鹿已死,次贷居然拖垮了华尔街,眼看他起高楼,眼看他宴宾客,眼看他楼塌了,寒冬来临。
11月
实验室越来越热闹了,大家果然混熟了。
化学果然是需要创意的。
12月
通宵一点感觉都没有。
一年过去,还是很消极。
祝各位新年快乐。

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寒秋日七同窗再聚首,物理系怪蜀黍终养成

五日秋风凛冽,寒透彻骨,晨有微雨,几应俊晖兄一语:“若有雨则不往矣”。然天公作美,午后始放晴,成就俊晖兄今日之主角。聚餐之前等车之处即以戏勋王为乐,言“wsn”云云,勋王惑,曰思不及其之迅,其呓语常人不得解。俊晖兄郁,转而问众:“汝等知一升半葡萄酒值几金?”众无语。“吾买止十文耳。”葡萄酒耶?葡萄汁耶?所论何意耶?
会餐之时俊晖兄愈发口无遮拦,挑逗勋王愈烈。时而自言自语,言今日充液氮几何,温甚低。众怪之:“北大理科皆异人乎?盛清谈之风乎?”答曰:“非也,物理系与数学系殊异,彼教之群论吾等不懂,吾教之群论其不懂也。”在坐皆顾左右:“何为群论?”释之:“所谓群论者,代数学之分支也,其定义之某数集,满足一,……;二,……”黄河泛滥一发不可收拾,颇有舍尔顿之风,切记不可使其口大开。后论及航天,又言吾之研究于外银河系,恐无用,皆空间物理天体物理等份内之物,空间物理涉……(省),天体物理涉……(省)。众狂倒,相递茶水以饮之,顾左右而言它。吾微颔,尚能言,俊晖兄叹曰:“唯学理科者知我矣。”或言俊晖兄应寻一女,应者四起,笑拒曰:“或二十年后可虑之。”二十年之期,不如摘炸药奖后孤老终身。此后更是冷笑话耍酷自言自语吐槽不绝,兼有计算机LabView实况三国志之高论,不禁叹道,俊晖兄何以沦为一代物理系怪蜀黍。比之勋王同为理工出身,犹出淤泥而不染,难能可贵。
至于其他人,张古依旧OL风范,一袭黑衣,上桌不久就来一句:“我给大家讲个笑话。”语气之夸张让吾等直接笑翻。清华也强人辈出,某告示曰:“……某人于寝半夜点火柴烤肉,几酿火灾……”勋王果然君子风度,面对俊晖兄始终一副无害之微笑。只是最后分别之时,匆忙上车,众纳闷良久,察站牌,实为反向耳,速告之。媛姐马尾萌,天然痴不改,发信息把北医搞成北航不说,问路久不得,张古一指,眼前偌大一指路牌,忙以未带眼镜为由推之;随便聊一句即:“某日买机票,竟忘带身份证……”不愧为媛姐……
席间虽无觥筹交错,然聊绵阳,聊南山,聊十二班诸兄,小白鼠的N种死法,生命合成,天南海北,无所不谈,笑语不断。一年难得聚之乐,遂志之。

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EVA·愛的藝術

A·T·Field,孤獨乃人類永恒的本質,但合作與對話乃至愛又是必需的能力。
EVA是一面鏡子,里面所有人虽然选择不同,但悲剧根源都是缺乏爱。
弗洛姆理想主義的愛在人間鮮有吧,不過百年過去,墮落的人類依然墮落,但也沒見被毀滅抑或被救贖的跡象。
人,也只有有智慧而又愚蠢的人,才會有成為神這種不切實際的幻想吧,才會把人非人化。

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《生命,宇宙,及一切》译本

 準備搶《科幻世界·译文版》08年9期
 长篇:
  
 生命、宇宙以及一切………………………………【英】道格拉斯·亚当斯 著 胡纾 译 

另:
http://blog.sina.com.cn/yinpy
熱心網友譯版

  "Now the world has gone to bed
  Darkness won't engulf my head
  I can see by infra-red
  How I hate the night
  
  Now I lay me down to sleep
  Try to count electric sheep
  Sweet dream wishes you can keep
  How I hate the night"
  
  --Marvin the Robot, How I Hate the Night, Hitchhiker's Guide to Galaxy. 

    马文木然地念道:

  此刻万物已入眠,
  
  黑暗不入我的眼,
  
  红外线我能看见,
  
  我讨厌夜晚。
   
  他停了停,像是要酝酿一下感情和艺术想象力。终于,又念出了第二节: 

    此刻我也躺上帘卷西风床,
  
  努力数着电绵羊,
  
  不必祝我睡得香,
  
  我讨厌晚上。
  
  ——翻译极有才!

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難道我只能搞量子化學了么?

這周第二次做安息香縮合,再次失敗。第一次好歹還有點點沉淀析出,這次完全就是澄清液體。絕望了!對這個完全按實驗步驟來做卻兩次都失敗的實驗絕望了!這一刻,讓我又陷入從化學競賽第一次進實驗室到上周的有機化學實驗,從無機實驗到滴定再到有機合成,少有順利成功的夢魘。

競賽時練習實驗,第一課是合成碳酸鈉,超了幾個小時,蒸發皿中零散的顆粒和別人的一大堆相比是慘不忍睹,也由是喊出了“要純度不要產率”的口號。以後的滴定,達到精度要求至少要做三遍。再到有機實驗基本操作,總是出各種詭異的問題導致重做,當然“詭異”是相對而言,僅是加熱很久沒一點反應此類,比起Y姐的磕磕碰碰,滴定管的膠頭在滴定時都能掉下來,弗如也。然後理所當然地在大家去買雞蛋餅時留守實驗室。到了有機合成,往往別人做了半小時發現問題不得不重來時,雖然我不必再走他們走過的彎路,但最後他們還是比我先完成,我也只能拿純度高了幾個百分點來阿Q一把。川大做實驗時,幾天都靠他們帶午飯。到最後考試是最失敗的一次,在學校用慣了加熱套,考試居然只有酒精燈,而且沒多久就燃盡了!酒精燈耽誤不少時間,但也沒落後多少,過濾時居然穿濾了,而且還是連續兩次!最後其他人已經乾燥好了,我還在減壓過濾,過濾後居然還是糊狀物!當時昏了,以為水分乾燥了就好,結果一乾燥就是2小時,時間就是這么慢慢流失的,5個小時的實驗就這么拖到7個小時。中途有人還喊“你打翻了我的產率啊!”,最後我看我的產率打不打翻都是一回事了。要純度不要產率,更是一個笑話。

實驗的陰影從此就在身邊徘徊,雖然我不信邪,但大一下的分析,無數次滴定管在滴定快結束時漏水,三次平行分析從來只能做兩次,精密度只能靠估算和修改有效數字才能達到要求,這些又讓人崩潰了。大二上的有機,連續幾次做不出產物,做鹵代烷時蒸餾得到幾滴混濁液;做格氏試劑時反應液突然噴出;做乙酰苯胺得到的產物用吹風機乾燥,結果漫天黃色絮狀物;又有許多次產物在天平上感量不出。一次又一次地分析實驗失敗原因,結果期末得分低得嚇人。

絕望的還有跟導師做的實驗。簡單的撕金膜,師兄成功過無數次,論文都發表了。輪到我做時,去年11月,沒成功,試了無數次,得出結論直線型結構撕不了,原因不明,然後儀器壞了;寒假換五邊形,終於成功了,但模板給錯了不能用;2月,儀器壞了;3月下旬又開始撕,五邊形,本來有即將成功的喜悅了,結果,失敗,原因不明。如果繼續堅持Chem is try原則,成功遙遙無期,真的絕望了!

總的來說,這篇文屬於標題黨。我想說的只是,面對實驗,我淚流滿面。

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柳柳竟这么走了……

 柳文扬
(1970,7,5——2007,7,1)




沉痛悼念!

解咒人、天城海城、星海迷踪
封面故事、不可信词典、惊悚DIY、九州自助游
T-mail、一日囚、外祖父悖论、毒蛇、膜……
虎牙

“当里个当,当里个当,闲言碎语先不要讲,先表表咱好汉柳文扬”



让我们仰望,知觉在远方
宏伟的弗洛伊德颤抖着思想。
透过母马
背叛是完美的。
恐怖建筑群在萝卜树上生长

让我们记忆,大脑在衣柜
卑鄙的条顿歇斯底里地入睡。
放弃袜子
月亮是冷酷的。
白痴炼金术士在狮子座里下跪

让我们渴求,历史在湾流
忧伤的荷马高保真地生锈。
忘记婴儿
电子是耻辱的。
欧几里德茶叶在刀锋上梦游

让我们微分,候鸟在鱼群
抑扬格的维生素溶解着谈心。
失去瓶子
开关是疯狂的。
超能力键盘在深渊背后飞奔

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菊之实验台

近日实验做得人几欲崩溃,友人重操旧业,赠词一首

你的玻棒
闪烁着火光
惨白的钠钾磷
浮在水上
烟雾迷茫
混合着炔氧
是谁在讲台上
冰冷地绝望

雨轻轻弹
朱红色的窗
我一生在纸上
被风吹乱
梦在远方
化成一缕香
随风飘散你的模样

菊酯灿烂的香
你的笔记已泛黄
电子天平旁
滴定管静静淌
误差混乱地涨
你的眼睛失了光
徒留那记录
在地面凝霜

花已向晚
飘落了灿烂
凋谢的世道上
一声嫖起
多少回响
牌桌分两半
怕你上不了岸
一辈子摇晃

谁的分析
缺失了封皮
潦草地涂几笔
又去消极
天微微亮
你轻声的叹
一夜惆怅如此委婉

老张慨然地伤
你的笑声常回荡
花落人断肠
烘干炉慢慢凉
北风乱夜未央
大浪淘沙几多还
徒留我孤单
在窗边相望

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